Morszczyn rozmnaża się na dwa sposoby. Przez fragmentacje plechy (czyli całego glonu), lub w sposób płciowy. W czasie rozmnażania płciowego na czubku rośliny tworzą się komórki jajowe, oraz plemniki. W zależności od gatunku komórki rozrodcze mogą powstawać na jednej, lub na dwóch, rozdzielnopłciowych roślinach. Zapłodnienie jest możliwe tylko przy udziale wody. Powstała w wyniku zapłodnienia zygota odrywa się od rośliny macierzystej i daje początek kolejnej roślinie.